MOBILedit! obsahuje dvě standardní lišty (toolbary):

• Hlavní lišta nástrojů 
  • Lišta obsahuje ikony společné pro všechny pluginy a základní funkce.
• Lišta editací
  • Kažký plugin má svou vlastní lištu editací, která se vždy zobrazí na pravé straně okna. Uvedené funkce jsou vždy specifické pro zvolený plugin.

Kromě uvedený toolbarů, je ještě k dispozici status bar s aktuálními informacemi o stavu programu.

Aktivní funkce jsou také dostupné skrze kontextové menu (přístupný klikem pravým tlačítkem myši na položku)

Hlavní lišta nástrojů:

Status bar: